有些微生物是有利於研究人員做研究的，所以需要將這些微生物菌種好好的保存起來。保存這些微生物一般是運用的冷凍技術，首先需要對盛放微生物菌種的儀器進行殺菌和消毒處理，避免這種微生物與其他微生物混合在一起，飯後將培養皿放於低溫狀態下保存。

　　取0.1~0.2ml菌體懸浮液，移植於適宜的瓊脂斜麵、平板培養基上，剩餘的菌液，注入適宜的液體培養基內，然後在建議的溫度下培養。若未能活化，或活化後有疑問時，請於收到菌種1個月內，通知保藏中心，經查證無誤後，即免費補寄。

　　注意事項：菌種活化前，請將安瓿管保存在6一10℃的環境下。厭氧菌的培養，如無特別說明，自開封至接種完成，均需以無氧氣體充填，以保持厭氧狀態。某些菌種經過冷凍幹燥保存後，延遲期較長，需連續兩次繼代培養才能正常生長，此時請將步驟二重複一次。

　　液氮超低溫保藏程序：容器的選擇：使用帶螺旋蓋的2ml塑料安培瓶。檢查安培瓶是否滲漏：用0.05%的亞甲基藍水溶液在4℃浸泡30-45分鍾，衝洗幹淨，棄去含有藍色染料的安培瓶，其餘的安培瓶備用。容器的滅菌：先用蒸餾水漂洗幹淨安培瓶，再用蒸餾水在滅菌鍋中121℃浸泡滅菌15分鍾，幹燥並將打印好的標簽放入安培瓶中，略擰緊螺旋蓋，再行121℃滅菌30分鍾。

　　保藏菌菌齡：處於生長量階段或對數生長期後期。保護劑：選用5-10%的甘油或二甲基亞碸作保護劑。甘油的準備：在121℃滅菌15分鍾，2-8℃貯存。甘油一般以兩倍所需濃度的水溶液保存，然後與同等量的細胞懸液混合。若不用細胞懸液，則以所需濃度的水溶液保存。

　　二甲基亞碸：用0.22um的聚四氟乙烯過濾膜過濾除菌。過濾膜預先用甲醇和二甲基亞碸漂洗。無菌的二甲基亞碸以10-15ml裝量2-8℃避光保存。分裝：在無菌條件下，將細胞懸液分裝於安培瓶中，並注入保護劑，擰緊螺旋蓋。